Ngoài việc sử dụng trong giáo dục, FlightGear còn có ứng dụng rộng rãi trong nghiên cứu hàng không và các lĩnh vực khoa học liên quan. Các nhà nghiên cứu sử dụng FlightGear để mô phỏng các tình huống bay, kiểm tra các lý thuyết về khí động học, tối ưu hóa các thiết kế máy bay và kiểm tra các hệ thống hàng không. FlightGear cung cấp một môi trường mô phỏng mạnh mẽ và chi tiết, cho phép các nhà nghiên cứu tiến hành các thử nghiệm mà không cần phải có